Корректно: Поскольку зеркал два, [то] образуются две электромагнитные волны.

Числительные два, три, четыре управляют родительным падежом ед. числа существительного (два зéркала), местоименное наречие сколько — родительным падежом мн. числа (сколько зеркал). Соответственно, для выбора правильной формы нужно просто понять, кто здесь власть.

Если существительное предшествует числительному, количество временно под вопросом, стоящим хоть и незримо, но остро: так как зеркал (сколько?) два. Если числительное стоит впереди, вопрос о количестве снимается сам собой: имеются два зеркала.

Обратите внимание: когда придаточная часть находится в начале предложения, открывающий ее союз так как желательно заменять союзом поскольку. Согласно определению Н. С. Валгиной, слово-скрепа то здесь входит в состав двойного союза поскольку... то и подчеркивает резолютивный характер главной части. Однако ради стилистической гладкости его можно бестрепетно и безбожно изъять.